Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms