Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKAA2P54646 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms