Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCR4P51679 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCR4P51679 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCR4P51679 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCR4P51679 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCR4P51679 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCR4P51679 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCR4P51679 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms