Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms