Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms