Protein–RNA interactions for Protein: P48634

PRRC2A, Protein PRRC2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2AP48634 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRRC2AP48634 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRC2AP48634 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms