Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRB2P47870 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRB2P47870 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRB2P47870 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRB2P47870 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRB2P47870 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms