Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK1P39086 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms