Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms