Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA1P35221 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms