Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG3P32926 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG3P32926 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG3P32926 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms