Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBP1P32455 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBP1P32455 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms