Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms