Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms