Protein–RNA interactions for Protein: P28068

HLA-DMB, HLA class II histocompatibility antigen, DM beta chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMBP28068 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DMBP28068 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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