Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms