Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA6P23229 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms