Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2P22307 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2P22307 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2P22307 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SCP2P22307 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCP2P22307 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCP2P22307 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2P22307 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2P22307 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms