Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms