Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms