Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP4AP20648 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP4AP20648 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP4AP20648 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP4AP20648 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP4AP20648 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP4AP20648 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP4AP20648 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP4AP20648 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms