Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGCP20142 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGCP20142 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGCP20142 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms