Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms