Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms