Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CPEP16870 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CPEP16870 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CPEP16870 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CPEP16870 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CPEP16870 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CPEP16870 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms