Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB1P16220 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms