Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSB-PGBD3P0DP91 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms