Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms