Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC192P0DO97 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC192P0DO97 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms