Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFB1P0C5Y9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms