Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms