Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR1AO95602 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR1AO95602 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms