Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DYSFO75923 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DYSFO75923 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms