Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms