Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSO75390 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSO75390 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSO75390 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSO75390 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms