Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COBLO75128 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COBLO75128 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COBLO75128 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COBLO75128 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLO75128 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLO75128 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLO75128 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COBLO75128 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COBLO75128 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COBLO75128 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLO75128 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms