Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms