Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms