Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TIMM17BO60830 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms