Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PLXNC1O60486 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNC1O60486 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms