Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms