Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRC1O43663 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRC1O43663 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRC1O43663 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRC1O43663 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRC1O43663 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRC1O43663 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRC1O43663 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRC1O43663 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRC1O43663 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms