Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms