Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTIFO43310 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTIFO43310 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTIFO43310 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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