Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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