Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms