Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1AO15047 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms