Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF5O00463 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms