Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms