Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP17L11C9JVI0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L11C9JVI0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms